Os efeitos secundários podem ocorrer após iniciar a terapia anti-retroviral mas diminuem ou desaparecem passadas algumas semanas. Outras vezes persistem até ao final do tratamento.

Alguns sintomas relacionados com os efeitos secundários são também condições de outros estados de saúde, desde infecções, desequilíbrios hormonais, depressão e o próprio VIH.

Sempre que tiver sintomas é importante que se aconselhe com a/o profissional de saúde para que este diagnostique a causa. Independentemente da gravidade ou persistência dos efeitos secundários pode sempre tentar algumas das sugestões apresentadas para minimizar ou solucionar o efeito desagradável. Apresentam-se alguns efeitos secundários mais comuns assim como sugestões para lidar com os mesmos.