Insónia, tonturas, dores de cabeça e outros efeitos secundários do sistema nervoso central ocorrem mais frequentemente com o uso diário do dolutegravir do que previam as pesquisas, e tendem a ocorrer mais entre as mulheres, nas pessoas com mais de 60 anos e nas pessoas a iniciaram o abacavir ao mesmo tempo.

O dolutegravir está associado a uma maior incidência de efeitos secundários neuropsiquiátricos comparativamente ao observado na pesquisa clinica. Por exemplo um estudo que decorreu na Holanda descobriu que 14% das pessoas que iniciaram o dolutegravir, entre 2014 e 2016, abandonaram este medicamento devido aos efeitos secundários, predominantemente insónia, ansiedade, depressão e psicose. Problemas gastrointestinais também foram citados como razão para mudar para outro medicamento.

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